MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013205	TGC	2	6	215770	215775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4502	NC_013205	GCCC	2	8	215782	215789	0 %	0 %	25 %	75 %	258510218
4503	NC_013205	CTC	2	6	215805	215810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510218
4504	NC_013205	GC	4	8	215811	215818	0 %	0 %	50 %	50 %	258510218
4505	NC_013205	GGCG	2	8	215822	215829	0 %	0 %	75 %	25 %	258510218
4506	NC_013205	TCG	2	6	215869	215874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4507	NC_013205	TCG	2	6	215881	215886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4508	NC_013205	CG	3	6	215899	215904	0 %	0 %	50 %	50 %	258510218
4509	NC_013205	CAT	2	6	215945	215950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
4510	NC_013205	CGA	2	6	215957	215962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4511	NC_013205	CGCGG	2	10	215985	215994	0 %	0 %	60 %	40 %	258510218
4512	NC_013205	CGG	3	9	215999	216007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
4513	NC_013205	TCG	2	6	216043	216048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4514	NC_013205	TCA	2	6	216082	216087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
4515	NC_013205	CGC	2	6	216089	216094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510218
4516	NC_013205	GTC	2	6	216159	216164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4517	NC_013205	GAG	2	6	216189	216194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
4518	NC_013205	CG	3	6	216209	216214	0 %	0 %	50 %	50 %	258510218
4519	NC_013205	ATC	2	6	216249	216254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
4520	NC_013205	GGC	2	6	216308	216313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
4521	NC_013205	GCT	2	6	216314	216319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4522	NC_013205	GCG	2	6	216321	216326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
4523	NC_013205	AAG	2	6	216330	216335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510218
4524	NC_013205	CGA	2	6	216362	216367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4525	NC_013205	ATCG	2	8	216372	216379	25 %	25 %	25 %	25 %	258510218
4526	NC_013205	TGA	2	6	216412	216417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510218
4527	NC_013205	TCG	2	6	216436	216441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4528	NC_013205	GGT	2	6	216464	216469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510218
4529	NC_013205	CGG	2	6	216533	216538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
4530	NC_013205	TCA	2	6	216574	216579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
4531	NC_013205	AGC	2	6	216583	216588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4532	NC_013205	CGA	2	6	216596	216601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
4533	NC_013205	CGG	2	6	216617	216622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
4534	NC_013205	GGA	2	6	216632	216637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
4535	NC_013205	GAT	2	6	216707	216712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510218
4536	NC_013205	CG	3	6	216762	216767	0 %	0 %	50 %	50 %	258510218
4537	NC_013205	CCT	2	6	216935	216940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510218
4538	NC_013205	CGGA	2	8	217214	217221	25 %	0 %	50 %	25 %	258510219
4539	NC_013205	CGA	2	6	217262	217267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
4540	NC_013205	CGC	2	6	217274	217279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510219
4541	NC_013205	GCC	2	6	217303	217308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510219
4542	NC_013205	GCA	2	6	217396	217401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
4543	NC_013205	TTC	2	6	217417	217422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510219
4544	NC_013205	TCC	2	6	217482	217487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510219
4545	NC_013205	GAG	2	6	217503	217508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510219
4546	NC_013205	GAAGTC	2	12	217542	217553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258510219
4547	NC_013205	GGCC	2	8	217574	217581	0 %	0 %	50 %	50 %	258510219
4548	NC_013205	TGA	2	6	217595	217600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510219
4549	NC_013205	CCA	2	6	217628	217633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510219
4550	NC_013205	GACG	2	8	217694	217701	25 %	0 %	50 %	25 %	258510219
4551	NC_013205	CG	3	6	217725	217730	0 %	0 %	50 %	50 %	258510219
4552	NC_013205	TTC	2	6	217848	217853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510219
4553	NC_013205	TCC	2	6	217893	217898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510219
4554	NC_013205	ACG	2	6	217909	217914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
4555	NC_013205	TTG	2	6	217927	217932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510219
4556	NC_013205	CGG	2	6	217950	217955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510219
4557	NC_013205	CGA	2	6	218000	218005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
4558	NC_013205	GCG	2	6	218008	218013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510219
4559	NC_013205	GC	4	8	218025	218032	0 %	0 %	50 %	50 %	258510219
4560	NC_013205	GGAT	2	8	218365	218372	25 %	25 %	50 %	0 %	258510220
4561	NC_013205	AGT	2	6	218385	218390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510220
4562	NC_013205	CGC	2	6	218424	218429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510220
4563	NC_013205	CT	3	6	218439	218444	0 %	50 %	0 %	50 %	258510220
4564	NC_013205	GTT	2	6	218490	218495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510220
4565	NC_013205	GCG	2	6	218526	218531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510220
4566	NC_013205	ACG	2	6	218537	218542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510220
4567	NC_013205	TCA	2	6	218601	218606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510220
4568	NC_013205	CGA	2	6	218784	218789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510220
4569	NC_013205	GACTT	2	10	218917	218926	20 %	40 %	20 %	20 %	258510220
4570	NC_013205	TGCA	2	8	218971	218978	25 %	25 %	25 %	25 %	258510220
4571	NC_013205	CAC	2	6	219064	219069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510220
4572	NC_013205	TTG	2	6	219083	219088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510220
4573	NC_013205	AGGTGA	2	12	219165	219176	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	258510220
4574	NC_013205	GGTG	2	8	219672	219679	0 %	25 %	75 %	0 %	258510221
4575	NC_013205	CA	3	6	219682	219687	50 %	0 %	0 %	50 %	258510221
4576	NC_013205	CTG	2	6	219746	219751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4577	NC_013205	CGC	2	6	219785	219790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510221
4578	NC_013205	GCGG	2	8	219808	219815	0 %	0 %	75 %	25 %	258510221
4579	NC_013205	GGA	2	6	219838	219843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510221
4580	NC_013205	GTG	2	6	219860	219865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
4581	NC_013205	GGT	2	6	219982	219987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
4582	NC_013205	GGA	2	6	219988	219993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510221
4583	NC_013205	CGA	2	6	220000	220005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4584	NC_013205	GCG	3	9	220022	220030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510221
4585	NC_013205	CCA	2	6	220072	220077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510221
4586	NC_013205	TCG	2	6	220143	220148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4587	NC_013205	ACG	2	6	220173	220178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4588	NC_013205	GGC	2	6	220221	220226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510221
4589	NC_013205	CAT	2	6	220246	220251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510221
4590	NC_013205	CAG	2	6	220253	220258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4591	NC_013205	CG	3	6	220261	220266	0 %	0 %	50 %	50 %	258510221
4592	NC_013205	TGA	2	6	220284	220289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510221
4593	NC_013205	TGG	2	6	220374	220379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
4594	NC_013205	TGG	2	6	220413	220418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
4595	NC_013205	CCG	2	6	220456	220461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510221
4596	NC_013205	ACG	2	6	220476	220481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4597	NC_013205	GGACG	2	10	220594	220603	20 %	0 %	60 %	20 %	258510221
4598	NC_013205	CGT	2	6	220609	220614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510221
4599	NC_013205	GGT	2	6	220615	220620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
4600	NC_013205	GC	3	6	220628	220633	0 %	0 %	50 %	50 %	258510221
4601	NC_013205	GGT	2	6	220648	220653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
4602	NC_013205	GCC	2	6	220677	220682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510221
4603	NC_013205	GATC	2	8	220699	220706	25 %	25 %	25 %	25 %	258510221
4604	NC_013205	CG	3	6	220714	220719	0 %	0 %	50 %	50 %	258510221
4605	NC_013205	TCA	2	6	220847	220852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510222
4606	NC_013205	CAC	2	6	220860	220865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510222
4607	NC_013205	CCA	2	6	220893	220898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510222
4608	NC_013205	GGT	2	6	220908	220913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510222
4609	NC_013205	CGG	2	6	220916	220921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510222
4610	NC_013205	CGC	2	6	220944	220949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510222
4611	NC_013205	ATG	2	6	220951	220956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510222
4612	NC_013205	GCT	2	6	220962	220967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510222
4613	NC_013205	TGG	3	9	221024	221032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510222
4614	NC_013205	GCC	2	6	221088	221093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510222
4615	NC_013205	GCG	2	6	221120	221125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510222
4616	NC_013205	CGGG	2	8	221130	221137	0 %	0 %	75 %	25 %	258510222
4617	NC_013205	GTG	2	6	221149	221154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510222
4618	NC_013205	TAC	2	6	221176	221181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510222
4619	NC_013205	CGT	2	6	221183	221188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510222
4620	NC_013205	CGAG	2	8	221189	221196	25 %	0 %	50 %	25 %	258510222
4621	NC_013205	CTA	2	6	221229	221234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510222
4622	NC_013205	TCG	2	6	221282	221287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510222
4623	NC_013205	GGCG	2	8	221310	221317	0 %	0 %	75 %	25 %	258510222
4624	NC_013205	GGA	3	9	221349	221357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510222
4625	NC_013205	CGC	2	6	221358	221363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510222
4626	NC_013205	CGG	3	9	221423	221431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510222
4627	NC_013205	TGC	2	6	221528	221533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510222
4628	NC_013205	CGA	2	6	221568	221573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510222
4629	NC_013205	GAT	2	6	221646	221651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510222
4630	NC_013205	AGC	2	6	221663	221668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510222
4631	NC_013205	GC	3	6	221678	221683	0 %	0 %	50 %	50 %	258510222
4632	NC_013205	GGT	2	6	221690	221695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510223
4633	NC_013205	CGG	2	6	221735	221740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
4634	NC_013205	GGC	2	6	221759	221764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
4635	NC_013205	GGA	3	9	221786	221794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510223
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4641	NC_013205	CG	3	6	221951	221956	0 %	0 %	50 %	50 %	258510223
4642	NC_013205	CCGCG	2	10	221957	221966	0 %	0 %	40 %	60 %	258510223
4643	NC_013205	ACG	2	6	221989	221994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510223
4644	NC_013205	TGC	2	6	222001	222006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
4645	NC_013205	CGT	2	6	222026	222031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
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4647	NC_013205	TGC	2	6	222079	222084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
4648	NC_013205	GCC	2	6	222099	222104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510223
4649	NC_013205	CCG	2	6	222119	222124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510223
4650	NC_013205	GGA	2	6	222143	222148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510223
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4652	NC_013205	CAT	2	6	222167	222172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510223
4653	NC_013205	CG	3	6	222202	222207	0 %	0 %	50 %	50 %	258510223
4654	NC_013205	GCCT	2	8	222219	222226	0 %	25 %	25 %	50 %	258510223
4655	NC_013205	TCG	2	6	222268	222273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510223
4656	NC_013205	GCG	2	6	222310	222315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510223
4657	NC_013205	TCGC	2	8	222342	222349	0 %	25 %	25 %	50 %	258510223
4658	NC_013205	ACG	2	6	222397	222402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510223
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4662	NC_013205	CGC	2	6	222647	222652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510224
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4666	NC_013205	CG	3	6	222710	222715	0 %	0 %	50 %	50 %	258510224
4667	NC_013205	CTCGAT	2	12	222739	222750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258510224
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4669	NC_013205	GGC	2	6	222951	222956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510224
4670	NC_013205	GC	3	6	222958	222963	0 %	0 %	50 %	50 %	258510225
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4674	NC_013205	GC	3	6	223092	223097	0 %	0 %	50 %	50 %	258510225
4675	NC_013205	GGA	2	6	223111	223116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510225
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4678	NC_013205	CGC	2	6	223224	223229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510225
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4689	NC_013205	TGGATC	2	12	223716	223727	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510226
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4692	NC_013205	TCG	2	6	223845	223850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510226
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4721	NC_013205	TCG	2	6	225359	225364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510227
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4724	NC_013205	CGA	2	6	225477	225482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510227
4725	NC_013205	GCATG	2	10	225504	225513	20 %	20 %	40 %	20 %	258510227
4726	NC_013205	CGGG	2	8	225521	225528	0 %	0 %	75 %	25 %	258510227
4727	NC_013205	TGC	2	6	225557	225562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510227
4728	NC_013205	GAC	2	6	225622	225627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510227
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4730	NC_013205	TGAA	2	8	231295	231302	50 %	25 %	25 %	0 %	258510229
4731	NC_013205	CAT	2	6	231324	231329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510229
4732	NC_013205	GC	3	6	231330	231335	0 %	0 %	50 %	50 %	258510229
4733	NC_013205	ACAA	2	8	231340	231347	75 %	0 %	0 %	25 %	258510229
4734	NC_013205	AGC	2	6	231388	231393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510229
4735	NC_013205	GGCCGC	2	12	231576	231587	0 %	0 %	50 %	50 %	258510229
4736	NC_013205	GAA	2	6	231588	231593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510229
4737	NC_013205	GA	3	6	231604	231609	50 %	0 %	50 %	0 %	258510229
4738	NC_013205	TCA	2	6	231913	231918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510230
4739	NC_013205	TCC	2	6	232030	232035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510230
4740	NC_013205	TGT	2	6	232040	232045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510230
4741	NC_013205	GCT	2	6	232073	232078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510230
4742	NC_013205	CTT	2	6	232085	232090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510230
4743	NC_013205	GCG	2	6	232145	232150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510230
4744	NC_013205	TCA	2	6	232162	232167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510230
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4746	NC_013205	GTT	2	6	232226	232231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510230
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4748	NC_013205	GGATG	2	10	232292	232301	20 %	20 %	60 %	0 %	258510230
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4859	NC_013205	GCG	2	6	237162	237167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510235
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4864	NC_013205	CG	3	6	237519	237524	0 %	0 %	50 %	50 %	258510235
4865	NC_013205	CGT	2	6	237544	237549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510235
4866	NC_013205	CGT	2	6	237676	237681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510235
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4982	NC_013205	CG	3	6	243294	243299	0 %	0 %	50 %	50 %	258510240
4983	NC_013205	AGA	2	6	243333	243338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510240
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4986	NC_013205	ACC	2	6	243427	243432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510240
4987	NC_013205	CG	3	6	243493	243498	0 %	0 %	50 %	50 %	258510240
4988	NC_013205	GTG	2	6	243508	243513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510240
4989	NC_013205	CGG	2	6	243540	243545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510240
4990	NC_013205	CTT	2	6	243601	243606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510240
4991	NC_013205	CGT	2	6	243662	243667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510240
4992	NC_013205	CGA	2	6	243672	243677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510240
4993	NC_013205	GCGT	2	8	243696	243703	0 %	25 %	50 %	25 %	258510240
4994	NC_013205	GGCG	2	8	243709	243716	0 %	0 %	75 %	25 %	258510241
4995	NC_013205	GCG	2	6	243828	243833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510241
4996	NC_013205	CGT	2	6	243875	243880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510241
4997	NC_013205	GCTCG	2	10	243908	243917	0 %	20 %	40 %	40 %	258510241
4998	NC_013205	GCG	2	6	243936	243941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510241
4999	NC_013205	ACG	2	6	243957	243962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510241
5000	NC_013205	TGG	2	6	244003	244008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510241

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